du bist in der shell von freenas oder nicht?
wenn du plex als plugin updaten möchtest, dann musst du in die shell von dem jail.
ein tip am rande; jemand hat heir ein script gebastelt oder verlinkt, dass automatisch jeden tag nach updates checkt und installiert, wenn du es möchtest. ich habe super erfahrungen damit gemacht.
noch ein tip: normalerweise brauchst du die shell bei freenas für freenas nicht. ich würde tunlichst vermeiden irgendwas zu ändern, wenn man nicht genau weiß, was man da macht.